Теория и практика параллельных вычислений

       

Передача данных от всех процессов одному процессу Операция редукции


В рассмотренной программе суммирования числовых значений имеющаяся процедура сбора и последующего суммирования данных является примером часто выполняемой коллективной операции передачи данных от всех процессов одному процессу. В этой операции над собираемыми значениями осуществляется та или иная обработка данных (для подчеркивания последнего момента данная операция еще именуется операцией редукции данных). Как и ранее, реализация операции редукции при помощи обычных парных операций передачи данных является неэффективной и достаточно трудоемкой. Для наилучшего выполнения действий, связанных с редукцией данных, в MPI предусмотрена функция:

int MPI_Reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype type, MPI_Op op, int root, MPI_Comm comm),

где

  • sendbuf — буфер памяти с отправляемым сообщением;
  • recvbuf — буфер памяти для результирующего сообщения (только для процесса с рангом root);
  • count — количество элементов в сообщениях;
  • type — тип элементов сообщений;
  • op — операция, которая должна быть выполнена над данными;
  • root — ранг процесса, на котором должен быть получен результат;
  • comm — коммуникатор, в рамках которого выполняется операция.

В качестве операций редукции данных могут быть использованы предопределенные в MPI операции – см. табл. 5.2.

Помимо данного стандартного набора операций могут быть определены и новые дополнительные операции непосредственно самим пользователем библиотеки MPI – см., например, [[4], [40] – [42], [57]].

Общая схема выполнения операции сбора и обработки данных на одном процессе показана на табл. 5.2. Элементы получаемого сообщения на процессе root представляют собой результаты обработки соответствующих элементов передаваемых процессами сообщений, т.е.:

где есть операция, задаваемая при вызове функции MPI_Reduce (для пояснения на рис. 5.3 показан пример выполнения функции редукции данных).

Следует отметить:

  • функция MPI_Reduce определяет коллективную операцию, и, тем самым, вызов функции должен быть выполнен всеми процессами указываемого коммуникатора.
    При этом все вызовы функции должны содержать одинаковые значения параметров count, type, op, root, comm;
  • передача сообщений должна быть выполнена всеми процессами, результат операции будет получен только процессом с рангом root;
  • выполнение операции редукции осуществляется над отдельными элементами передаваемых сообщений. Так, например, если сообщения содержат по два элемента данных и выполняется операция суммирования MPI_SUM, то результат также будет состоять из двух значений, первое из которых будет содержать сумму первых элементов всех отправленных сообщений, а второе значение будет равно сумме вторых элементов сообщений соответственно;
  • не все сочетания типа данных type и операции op возможны, разрешенные сочетания перечислены в табл. 5.3.


Таблица 5.2. Базовые (предопределенные) типы операций MPI для функций редукции данныхОперацииОписание
MPI_MAXОпределение максимального значения
MPI_MINОпределение минимального значения
MPI_SUMОпределение суммы значений
MPI_PRODОпределение произведения значений
MPI_LANDВыполнение логической операции "И" над значениями сообщений
MPI_BANDВыполнение битовой операции "И" над значениями сообщений
MPI_LORВыполнение логической операции "ИЛИ" над значениями сообщений
MPI_BORВыполнение битовой операции "ИЛИ" над значениями сообщений
MPI_LXORВыполнение логической операции исключающего "ИЛИ" над значениями сообщений
MPI_BXORВыполнение битовой операции исключающего "ИЛИ" над значениями сообщений
MPI_MAXLOCОпределение максимальных значений и их индексов
MPI_MINLOCОпределение минимальных значений и их индексов


Рис. 5.2.  Общая схема операции сбора и обработки на одном процессе данных от всех процессов



Таблица 5.3. Разрешенные сочетания операции типа операнда в операции редукцииОперацииДопустимый тип операндов для алгоритмического языка C
MPI_MAX, MPI_MIN, MPI_SUM, MPI_PRODЦелый, вещественный
MPI_LAND, MPI_LOR, MPI_LXORЦелый
MPI_BAND, MPI_BOR, MPI_BXORЦелый, байтовый
MPI_MINLOC, MPI_MAXLOCЦелый, вещественный


Рис. 5.3.  Пример выполнения операции редукции при суммировании пересылаемых данных для трех процессов (в каждом сообщении 4 элемента, сообщения собираются на процессе с рангом 2)

Применим полученные знания для переработки ранее рассмотренной программы суммирования: как можно увидеть, весь программный код, выделенный рамкой, может быть теперь заменен на вызов одной лишь функции MPI_Reduce:

// Сборка частичных сумм на процессе с рангом 0 MPI_Reduce(&ProcSum, &TotalSum, 1, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD);


Содержание раздела